人类禽流感临床特征与普通流感应该是相似的，患者主要表现为发热、头痛、乏力、肌痛、咽痛、咳嗽等症状。然而，对比目前记载的人类禽流感病例，可以发现人类禽流感的临床表现可能比此前的描述更为复杂多样。人类H5N1禽流感潜伏期可能比此前所知的流感潜伏期都要长，目前报道的H5N1禽流感患者一般在禽类接触2～4天后发病，最长可在12天后发病。始发症状一般包括高热和下呼吸道症状，偶见上呼吸道症状。部分患者会出现腹泻、呕吐、胸膜痛、鼻及牙龈出血等症状。但越南2例H5N1禽流感患者并没有早期呼吸道症状，而是表现为严重腹泻，很快发展为昏迷并死亡，临床诊断为急性脑炎。人类禽流感的临床表现可能比已知的更为广泛，对禽流感患者的监测不能仅仅局限于呼吸系统疾病的患者，其他不明原因的死亡或严重的临床表现都应注意排除人类禽流感的可能。大多数禽流感患者出现下呼吸道症状，一般在发病5天内出现呼吸困难、气短或呼吸窘迫。H5N1禽流感患者可出现肺部浸润。胸部影像学检查可表现为肺内片状影。重症患者肺内病变进展迅速，呈大片状毛玻璃样影及肺实变影像，病变后期为双肺弥漫性实变影，可合并胸腔积液。多数患者白细胞明显降低，少数因继发细菌感染而升高。淋巴细胞大多降低，有出血征象者血小板降低，ALT、AST可异常。重症患者可出现高热不退，病情发展迅速，几乎所有患者都表现明显的肺炎，可出现急性肺损伤、急性呼吸窘迫综合征、肺出血、胸腔积液、全血细胞减少、多脏器功能衰竭、休克及瑞氏综合征等多种并发症。可继发细菌感染，发生败血症。泰国H5N1患者一般在发病4～13天内出现ARDS，并伴随肾功能衰竭、心律失常、心脏扩大等多器官衰竭。H5N1禽流感重症患者一般在发病6～30天内死亡。